Les Slovaques ont hérité des Hongrois leur culture scientifique. Même si les contributions des deux pays ne sont pas comparables, les Slovaques ont également produit des scientifiques et des chercheurs de renommée mondiale. Le mathématicien et astronome slovaque Maximilián Hell (1720-1792) fut le premier à calculer la distance entre la Terre et le Soleil. La première université du pays, l'Academia Istropolitana de Bratislava fut fondée dès 1465. En 1762, l'Impératrice Marie-Thérèse fonda à Banská Stiavnica la première école des Mines au monde, qui servit notamment de modèle à l'Ecole Polytechnique de Paris. Selon l'OCDE, la Slovaquie comptait en 2002 entre 30 et 70 % de chercheurs pour mille habitants que la Hongrie, la République tchèque et la Pologne.

Le système d'enseignement slovaque est de niveau honorable. La Slovaquie contemporaine ne compte quasiment pas d'analphabétisme, hormis au sein de la population rom. Après la Révolution de Velours, des écoles privées et des écoles dirigées par l'Église ont été créées. Enrichis de savoirs sur l'économie de marché et sur les nouvelles technologies, les programmes d'études s'axent nettement sur la pratique.

Cependant, avec seulement 3,9 % des depenses publiques et privées du PIB dans le secteur de l'enseignement, la Slovaquie se situe à l'avant-dernier rang des pays de la zone de l'OCDE. Avec 73 % dans les écoles secondaires du deuxième cycle et moins de 20 % dans l'enseignement supérieur, les taux d'inscription scolaire sont plus faibles que dans les autres pays d'Europe centrale.

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