Malgré une orientation clairement libérale, les différents gouvernements estoniens se sont attachés à maintenir un certain niveau de protection sociale dans le pays.

L'Estonie souffre d'un problème d'environnement. L'air est pollué par le dioxyde du soufre et par les combustions des usines de raffinage du pétrole au Nord-Est. Le pays souffre par ailleurs de la contamination du sol et de ses nappes d'eau par les résidus pétroliers et autres produits chimiques des anciennes bases militaires soviétiques.

Parmi les perdants de la transition figurent les chomeurs de plus de cinquante ans, que l'on retrouve notamment concentrés dans le nord-est du pays.